This is Heestory

Sample contamination 이란 NGS 실험하는 사람이라면 누구나 한번쯤 생각해볼법한 이슈이다. 실험하다가 옆에 well에 contam 되기는 매우 쉽지만, 어떤 샘플에 의해 contam이 되었는지 알아내기는 어렵다. 이러한 contamination issue를 해결하기 위해 몇가지 tool을 찾아본 결과 ArtDeCo라는 tool을 발견하였다. 1. ArtDeCo 란? NGS를 이용한 DNA sample 사이의 cross-contamination을 알아낼 수 있도록 개발한 tool 이다. 아래 논문을 보면 batch 내 샘플들에게서 중복되는 SNV의 AR(Alleic ratio) 확인하여 샘플들의 Contamination을 확인한다. https://bmcbioinformatics.biomed..

파이썬 for문을 이용하여 몇가지 유용한 방법들을 알아보자. 1. range 를 사용한 for 문 이용 range를 이용하면 시작부터 끝값 까지 사용자가 범위를 설정 가능하다. for문을 이용하여 원하는 범위의 숫자, 홀수, 짝수 등 출력 가능하다. #for 실습 for v1 in range(4): print('v1 is:', v1) for v2 in range(1,11): print('v2 is :' , v2) for v3 in range(0,11,2): print('v3 is:', v3) sum=0 for v in range(1,1001): sum += v print(sum) print(type(range(1,11))) 2. Dictionary를 사용한 for 문 이용 Dictionary의 key 값..

1. python 버전 알아내기 python --version 2.python 설치된 경로 알아내기 일단 리눅스에서 $python을 치고 python을 실행한다. $python import sys sys.executable sys.executable을 치면 현재 사용하고 있는 파이썬의 경로가 나온다.