Slow and Steady Biology

Sample contamination 이란 NGS 실험하는 사람이라면 누구나 한번쯤 생각해볼법한 이슈이다. 실험하다가 옆에 well에 contam 되기는 매우 쉽지만, 어떤 샘플에 의해 contam이 되었는지 알아내기는 어렵다. 이러한 contamination issue를 해결하기 위해 몇가지 tool을 찾아본 결과 ArtDeCo라는 tool을 발견하였다. 1. ArtDeCo 란? NGS를 이용한 DNA sample 사이의 cross-contamination을 알아낼 수 있도록 개발한 tool 이다. 아래 논문을 보면 batch 내 샘플들에게서 중복되는 SNV의 AR(Alleic ratio) 확인하여 샘플들의 Contamination을 확인한다. https://bmcbioinformatics.biomed..

에러 원인: A.py 라는 파이썬 스크립트를 bash A.py로 돌렸다. 해결: python A.py로 돌리기 bash --> python 추가적으로 찾아보니 스크립트 맨 위에 #!/usr/bin/python 이라고 안써서 나오는경우도 있다고함.

📗컴퓨터활용능력 2급 실기 이번주 주말에 컴활 시험이기 때문에 이번주에는 컴활공부를 많이 할 예정이다. -시나공 기본모의고사 01회, 02회 피벗테이블을 중점적으로 공부하였다. 데이터 분석부분이 평소에 사용하지 않던 부분이라 익숙하지 않았다. 계속 기출문제를 풀어보는게 중요할것 같다. 📘JAVA 공부 [부스트코스::쉽게배우는 자바] Chapter 08.변수의 정의~데이터타입의 변환 자바에서 변수를 정의할때 먼저 데이터 타입을 선언한다. 실수 데이터 : double 정수 데이터 : int 문자열 데이터 : string 변수를 지정하는 이유: 변수를 지정하면, 자주 사용하는 데이터를 여러번 재사용할 수 있고, 만약 이름을 수정할 경우, 변수의 값만 수정하면 되기 때문에 효율적으로 처리할 수 있다. 오늘배운 ..

📗컴퓨터활용능력 2급 실기 -1장. 기본작업 외부데이터, 셀서식, 조건부서식, 고급필터 -기출문제 3회 요즘 코딩공부랑 컴활 공부랑 같이하니까 함수이름이 헷갈린다. 이게 바로 부작용인것일까. 시험 3일전부터는 컴활공부만 해야겠다. 그리고 아무래도 이론공부랑 기출문제를 함께 병행하는게 좋을것 같아 이론공부도 시작. 📘생활코딩 -Tensorflow 시작 딥러닝이라는 이름으로 유명해진 인공신경망과 이를 구현하는 것을 도와주는 도구 텐서플로우 라이브러리에 대해 배웠다. 레모네이드 판매예측과 관련한 예시를 통하여서 딥러닝 모델을 만들어보았다. 📘JAVA 공부 [부스트코스::쉽게배우는 JAVA] -Chapter 5~6까지 완료 java를 이용한 사칙연산, Math 클래스를 이용한 계산 문자열의 표현-Characte..

📗컴퓨터활용능력 2급 실기 -기출문제 2회 풀기 -해설강의 듣기+함수정리 IF:조건판단 IF(조건, 참, 거짓) RIGHT:오른쪽부터 문자열 추출 RIGHT(문자열, 추출할 개수) MID:지정한 위치에서부터 문자추출 MID(문자열, 시작위치, 추출할개수) INDEX: 지정한 행과 열에 해당하는 값 출력 INDEX(배열, 행번호, 열번호) DCOUNTA:조건에 맞는 자료의 개수 DCOUNTA(표의범위, 필드, 조건) COUNT: 범위에서 숫자가 포함되는 셀의 개수 COUNT(표의 범위) COUNTA: 범위에서 비어있지 않은 셀의 개수 COUNTA(표의 범위) TRUNC: 소수이하 잘라내기 TRUNC(인수, 자릿수) HLOOKUP: 수평데이터 찾기 HLOOKUP(찾는값, 참조영역(F4누르기), 행번호, 범위..

📗컴퓨터활용능력 2급 실기 -컴활 인강 2강(모의고사 2회) -엑셀 함수 정리하기 오늘 드디어 배송시켰던 컴활책이 도착하였다. 그동안 책이 안와서 인강만 듣고 문제를 풀었는데 이제 함수 부분도 차근차근 알아볼 수 있게 되었다. 시험까지 약10일정도 남았으니 기출문제 돌리고 부족한 부분은 인강과 책으로 보충할 계획이다. 📘생활코딩 -1-7. 머신러닝머신~1-14. 심리전 까지 인강 들음 독립변수와 종속변수에 대해 배웠는데 간단하게 설명하면 다음과 같다. 독립변수 = 원인이 되는 열 종속변수 = 결과가 되는 열 데이터 중에서 어떤것이 독립변수인지 종속 변수인지를 구별하는게 중요하다. -머신러닝을 통해 해결하고 싶은 문제점 찾기 환경: 인턴생활 중인 대학생 불만족: 인턴생활을 할 때 팀원들과 함께 점심 또는 ..