Bioinformatics Issue

[강연]유전자 가위 활용 질병 진단 기술

히스톤 2024. 11. 21. 09:26

생명공학 연구원 강태준 박사

 

발표 주제: 유전자 가위 활용 질병 진단 기술
발표 초록
액체 생검에서 발견되는 세포외 소포체(EV)의 메신저 RNA(mRNA) 서열 분석은 체세포 돌연변이, 내성 프로파일 및 종양 재발과 같은 임상 정보를 제공할 수 있습니다. 그러나 EV mRNA는 액체 생검에서 낮은 농도로 존재하기 때문에 대량의 샘플 또는 특수 분석 기법이 필요해 널리 활용되지 않고 있습니다. 여기에서 우리는 EV mRNA를 검출하기 위한 플랫폼인 SCOPE(Self-amplified and CRISPR-aided Operation to Profile EVs)를 소개합니다. SCOPE는 Cas13을 이용한 CRISPR 기반 타겟 RNA 인식을 활용하여 복제와 신호 증폭을 유도하여, 단일 뉴클레오타이드 분해능을 유지하면서도 아토몰 이하의 검출 한계를 달성했습니다. KRAS, BRAF, EGFR 및 IDH1 유전자의 주요 돌연변이에 대한 프로브를 설계하고 단일 용기에서 분석할 수 있는 프로토콜을 최적화했으며, 다중 샘플 검출을 위한 장치를 구현했습니다. SCOPE는 동물 모델에서 초기 단계 폐암을 검출하고, 대장암 환자의 종양 돌연변이 부담을 모니터링하며, 교모세포종 환자들의 분류를 가능하게 했습니다